记者11月5日从中科大获悉,该校科学家在蛋白质设计领域取得重要进展,成功实现给定目标结构的蛋白全序列从头设计,成果发表在《自然·通讯》杂志上。
蛋白质是一种长链状生物大分子,由不同类型氨基酸按照特定顺序串联而成,是生命功能的主要执行者。蛋白质设计是人工指定蛋白质的氨基酸序列,使其具有预期的三维结构和功能。近年来,国际上在该领域取得一些重要进展,展示了在疫苗研发、合成生物学等领域的重大前景。但迄今为止,有实验验证报道的自动设计方法只有一两种,不仅成功率低,而且判别所设计的蛋白质能否形成稳定三维结构也十分困难,这极大阻碍了蛋白质设计的广泛应用。
研究中,中科大生命科学学院刘海燕教授、陈泉副教授研究组建立了一种用全新策略构建的统计能量函数,用于蛋白质设计。理论分析表明,其设计结果显著不同于、且在一些重要方面优于现有最好的蛋白质设计模型。同时,他们利用一种基于细菌细胞耐药性报告蛋白质折叠好坏的方法,来快速检测人工设计的蛋白质是否能折叠成稳定的三维结构,不仅检测效率高,还能通过实验筛选对设计做出改进。刘海燕称,该工作建立了蛋白质从头设计的新途径,其效果能够达到甚至可能超过现有最好方法,为蛋白质结构功能的设计改造提供了新工具。(桂运安)
来源:安徽日报 2014年11月06日